اعتمدت اللجنة المنظمة لبطولة دوري أبطال العرب أسماء الفرق المشاركة في البطولة في نسختها السادسة 2008 / 2009 بعد اجتماع عقد الخميس بمدينة أغادير بالمغرب.
وذكر الموقع الرسمي للإتحاد العربي 31 فريقاً من 16 دولة عربية بالإضافة لأربع فرق من أربع دول عربية أخرى سيجري بينهما تصفيات لاختيار الفائز فيها لتكملة الـ 32 فريق المشاركين في فعاليات البطولة.
السعودية : الوحدة - الحزم
مصر: الإسماعيلي
الجزائر : وفاق سطيف -اتحاد العاصمة- اتحاد عنابه
تونس : الترجي الرياضي- الاتحاد المنستيري- الصفاقسي
المغرب : الرجاء الرياضي – حسنية اغادير- الوداد الرياضي
الأردن : الوحدات – شباب الأردن – الفيصلي.
الكويت : الكويت الكويتي- القادسية-العربي
العراق : نادي العراق
سوريا : الاتحاد – الطليعة
السودان : الهلال – المريخ
ليبيا : أهلي طرابلس – الاتحاد
لبنان : الأنصار، عمان : ظفار
البحرين : البسيتين
الإمارات : الشعب
اليمن : الهلال الرياضي
موريتانيا : النصر السبخه.
وسيتم عمل تصفيات للفرق أدناه لاختيار فريق واحد يكمل قائمة الـ32 فريق المشاركين في البطولة وستقام تصفياتها في جيبوتي عقب عطلة عيد الفطر المبارك.
فلسطين: واد النيص
جيبوتي : العقارية
جزر القمر : جاكم
الصومال : دلو